MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017800	ATT	2	6	89	94	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858844
2	NC_017800	CTT	2	6	140	145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858844
3	NC_017800	CT	3	6	206	211	0 %	50 %	0 %	50 %	386858844
4	NC_017800	T	6	6	219	224	0 %	100 %	0 %	0 %	386858844
5	NC_017800	CTTT	2	8	226	233	0 %	75 %	0 %	25 %	386858844
6	NC_017800	T	6	6	231	236	0 %	100 %	0 %	0 %	386858844
7	NC_017800	ATT	2	6	290	295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858844
8	NC_017800	T	6	6	407	412	0 %	100 %	0 %	0 %	386858844
9	NC_017800	TAT	2	6	442	447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858844
10	NC_017800	ATGA	2	8	484	491	50 %	25 %	25 %	0 %	386858844
11	NC_017800	TAA	2	6	503	508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858844
12	NC_017800	TCA	2	6	522	527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858844
13	NC_017800	TAG	2	6	529	534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858844
14	NC_017800	AT	3	6	564	569	50 %	50 %	0 %	0 %	386858844
15	NC_017800	TCTT	2	8	590	597	0 %	75 %	0 %	25 %	386858844
16	NC_017800	ATT	2	6	710	715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858844
17	NC_017800	T	6	6	827	832	0 %	100 %	0 %	0 %	386858844
18	NC_017800	CTT	2	6	918	923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858844
19	NC_017800	AAG	2	6	928	933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858844
20	NC_017800	T	6	6	969	974	0 %	100 %	0 %	0 %	386858844
21	NC_017800	AT	3	6	984	989	50 %	50 %	0 %	0 %	386858844
22	NC_017800	TTG	2	6	1010	1015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858844
23	NC_017800	ATT	2	6	1130	1135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858844
24	NC_017800	AAT	2	6	1307	1312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858844
25	NC_017800	ATC	2	6	1349	1354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858844
26	NC_017800	TTTCA	2	10	1355	1364	20 %	60 %	0 %	20 %	386858844
27	NC_017800	T	6	6	1389	1394	0 %	100 %	0 %	0 %	386858844
28	NC_017800	AGC	2	6	1475	1480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858844
29	NC_017800	T	8	8	1489	1496	0 %	100 %	0 %	0 %	386858844
30	NC_017800	AAC	2	6	1527	1532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858844
31	NC_017800	GTTTT	2	10	1577	1586	0 %	80 %	20 %	0 %	386858844
32	NC_017800	T	6	6	1664	1669	0 %	100 %	0 %	0 %	386858844
33	NC_017800	AAT	2	6	1744	1749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858844
34	NC_017800	TCTT	2	8	1847	1854	0 %	75 %	0 %	25 %	386858844
35	NC_017800	TCT	2	6	1896	1901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858844
36	NC_017800	ATT	2	6	1902	1907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858844
37	NC_017800	T	8	8	1906	1913	0 %	100 %	0 %	0 %	386858844
38	NC_017800	TAAA	2	8	1951	1958	75 %	25 %	0 %	0 %	386858844
39	NC_017800	TCA	2	6	2091	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858844
40	NC_017800	GAT	2	6	2175	2180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858844
41	NC_017800	CATA	2	8	2188	2195	50 %	25 %	0 %	25 %	386858844
42	NC_017800	CTT	2	6	2214	2219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858844
43	NC_017800	TCT	2	6	2247	2252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858844

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.